MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY08

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009474	A	6	6	5	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009474	C	8	8	68	75	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_009474	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009474	T	7	7	101	107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009474	CTGC	2	8	147	154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009474	AGG	2	6	197	202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009474	GGC	2	6	255	260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009474	GAT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009474	CGG	2	6	316	321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009474	CG	3	6	333	338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009474	GGCGCG	2	12	357	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009474	GA	3	6	417	422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009474	GGC	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009474	GCG	2	6	460	465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009474	CCT	2	6	560	565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009474	TAG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009474	TGG	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009474	CCG	2	6	643	648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_009474	CTG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009474	CCG	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009474	CAG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009474	ACA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009474	GCGG	2	8	912	919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009474	GA	3	6	929	934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009474	GCA	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009474	AGCA	2	8	1144	1151	50 %	0 %	25 %	25 %	148244134
27	NC_009474	GCG	2	6	1180	1185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
28	NC_009474	CG	3	6	1228	1233	0 %	0 %	50 %	50 %	148244134
29	NC_009474	CGG	2	6	1244	1249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
30	NC_009474	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244134
31	NC_009474	CGT	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244134
32	NC_009474	CCGG	2	8	1335	1342	0 %	0 %	50 %	50 %	148244134
33	NC_009474	GCC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
34	NC_009474	TGCCC	2	10	1413	1422	0 %	20 %	20 %	60 %	148244134
35	NC_009474	GCC	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
36	NC_009474	CGCC	3	12	1448	1459	0 %	0 %	25 %	75 %	148244134
37	NC_009474	AGG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244134
38	NC_009474	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244134
39	NC_009474	TGA	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244134
40	NC_009474	ATC	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244134
41	NC_009474	TGC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009474	CGC	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009474	GTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
44	NC_009474	GATC	2	8	1856	1863	25 %	25 %	25 %	25 %	148244135
45	NC_009474	GAG	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244135
46	NC_009474	GGT	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
47	NC_009474	AGC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
48	NC_009474	TGA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244135
49	NC_009474	GCA	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
50	NC_009474	GCTG	2	8	2347	2354	0 %	25 %	50 %	25 %	148244135
51	NC_009474	ATC	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009474	CGA	3	9	2535	2543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009474	GCG	2	6	2566	2571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009474	ATG	2	6	2593	2598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009474	CAT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009474	GCC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009474	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009474	CAT	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009474	TCAG	2	8	2674	2681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009474	CAT	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009474	CAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009474	CATCC	2	10	2713	2722	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_009474	GGTA	2	8	2809	2816	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009474	GTT	2	6	2954	2959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009474	GTG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009474	GC	3	6	3011	3016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009474	CAT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009474	TGC	2	6	3075	3080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009474	CAT	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009474	CAT	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009474	CAT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009474	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009474	GCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009474	TGC	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009474	ACG	2	6	3253	3258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009474	TC	3	6	3276	3281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009474	GATT	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009474	CAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009474	AAAG	2	8	3332	3339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009474	CAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244136
81	NC_009474	GGT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244136
82	NC_009474	TCG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244136
83	NC_009474	GCTTG	2	10	3528	3537	0 %	40 %	40 %	20 %	148244136
84	NC_009474	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
85	NC_009474	GAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244136
86	NC_009474	GGC	2	6	3666	3671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
87	NC_009474	GC	3	6	3755	3760	0 %	0 %	50 %	50 %	148244136
88	NC_009474	GGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
89	NC_009474	CAG	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
90	NC_009474	AGC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
91	NC_009474	CCT	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244137
92	NC_009474	C	6	6	4036	4041	0 %	0 %	0 %	100 %	148244137
93	NC_009474	TGG	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244137
94	NC_009474	GGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
95	NC_009474	CGG	2	6	4322	4327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
96	NC_009474	GGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
97	NC_009474	TCG	3	9	4428	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138
98	NC_009474	CCG	2	6	4447	4452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244138
99	NC_009474	TGT	2	6	4526	4531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244138
100	NC_009474	CAT	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244138
101	NC_009474	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138
102	NC_009474	CAAT	2	8	4869	4876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.